±Kontrolerzy zbadali Izba zbadała działalność szpitala w okresie między 2022 r. a 2025 r. Wykazali Kontrolę rozpoczęto we wrześniu 2025 r. W raporcie wykazane zostały nieprawidłowości m.in. w sposobie organizacji pracy personelu medycznego, który powodował przeciążenie pracą. Zastrzeżenia budzą też: nieodpowiednie gospodarowanie należącym do szpitala sprzętem medycznym, stan techniczno-sanitarny oraz wyposażenie niektórych pomieszczeń, czy funkcjonowanie Warszawskiego Centrum Chirurgii Kręgosłupa, które formalnie nie istniało w strukturach placówki.
±NIK przekazała też, m.in., że regulamin organizacyjny placówki zawierał informacje niezgodne ze stanem faktycznym. Znajdowały się w nim np. niefunkcjonujące komórki organizacyjne takie jak "Poradnia chirurgii onkologicznej I" i "Poradnia chirurgii onkologicznej II". "Były też wpisane do rejestru podmiotów wykonujących działalność leczniczą (RPWDL), a organowi prowadzącemu rejestr nie zgłoszono zmian w tym zakresie" — czytamy.
−"NIK przeprowadziła kontrolę Warszawskiego Szpitala Południowego w celu weryfikacji potencjalnie istotnych problemów zidentyfikowanych w trakcie analizy przedkontrolnej, w tym wpływu funkcjonowania szpitala tymczasowego w siedzibie WSzP na jego obecną sytuację finansową. Kontrola objęła lata 2022-2025, została rozpoczęta we wrześniu 2025 r. z inicjatywy własnej NIK" — przekazano.