±O potwierdzenie ważności referendum wnioskował m.in. komisarz wyborczy w Krakowie, Dagmara Daniec-Cisło, która kwestionowała podstawy do protestu. Protest zgłoszony przez Edwarda E. Nowaka, opozycjonistę z czasów PRL, dotyczył rzekomego łamania ciszy wyborczej referendalnej i wykorzystywania mediów społecznościowych do agitacji. Według niego 23 i 24 maja doszło do ok. 3,8 mln wyświetleń treści na platformie X oraz 430 tys. na YouTube, które miały naruszać przepisy dotyczące ciszy referendalnej.
±Zastrzeżenia wobec przebiegu referendum zgłosił Edward E. Nowak - złożył on oficjalny protest wskazując na łamanie ciszy wyborczej referendalnej oraz działalność w mediach społecznościowych. Sąd jednak nie uznał tych argumentów za wystarczające, by unieważnić głosowanie. Pozostałe trzy protesty zgłoszone do sądu nie były rozpatrywane, ponieważ nie spełniały wymogów formalnych, m.in. zostały wniesione po terminie.
±Swoją kandydaturę na urząd prezydenta Krakowa zgłosili już m.in.: Marian Banaś (były prezes Najwyższej Izby Kontroli), Bartosz Bocheńczak (Konfederacja), Michał Drewnicki (PiS), inicjator referendum Jan Hoffman, Michał Klimek (Konfederacja Korony Polskiej), Aleksandra Owca (Partia Razem), Monika Piątkowska (KO, PSL), Sławomir Pietrzyk (Socjaldemokracja Polska), Marta Ratuszyńska (Dobry Radom), Marianna Schreiber (celebrytka), Schreiber, Grażyna Zofia Świat (Bezpartyjni Samorządowcy Małopolski) i były radny Krakowa Łukasz Wantuch.